WWW.KNIGI.KONFLIB.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

 
<< HOME
Научная библиотека
CONTACTS

Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |   ...   | 12 |

« ...»

-- [ Страница 1 ] --

ВОЗМОЖНАЯ РОЛЬ ГИПОТЕТИЧЕСКИХ

МЕХАНИЗМОВ В ПРОИСХОЖДЕНИИ ГЕНОМОВ

(В ЧАСТНОСТИ – ВИЧ)

А.М. Дейчман

Введение.

Малая часть большого клубка

В данной статье я попытаюсь остановиться только на тех узловых

моментах, которые непосредственно связывают ВИЧ/СПИД-проблему

с развиваемой гипотезой (концепцией) существования нового фундаментального механизма вариабельной поэпитопной обратной трансляции (вПОТ) отдельного белкового эпитопа (в рамках системы координат, где требуются и дополнительные механизмы; часть их уже известна). Теоретическое осмыслении проблемы в биологии/медицине обычно считают малоприемлемым. Этот механизм, вероятно, связан с: появлением случайно-программируемых точечных/ /неточечных мутаций;

регуляцией и поддержанием стабильности/изменчивости геномов клеток/вирусов в рамках логически замкнутой, но реально открытой белково-нуклеиновой системы. Детально с материалом можно ознакомиться в работах, представленных на сайте (http://amdeich-var-reversetranslation.ru); подробно данная статья представлена на сайтах (http://www.hiv-aids-epidemic.com.ua/index.htm; http://www.hiv-aidsepidemic.com.ua/indexenviro-2011-1.htm). Тексты к рисункам (1–3) и схемам (1–4), сами рисунки, схемы (списки литературы, сокращений) представлены в конце статьи. Некоторый обзорный материал необходим для продвижения в данном направлении в будущем. Значимость предлагаемого механизма, если он/подобный будет показан, сравнима с таковой для синтезов белка и нуклеиновых кислот. Это связано с вытекающими из гипотезы (концепции) следствиями.

Механизм, чем-то подобный предложенному, описан в работе M.Nashimoto (имеется и на моем сайте) [89]. В каждом типе клеток, как и в случае синтезов белка и нуклеиновых кислот, гипотетический вПОТ-механизм вероятно встроен специфически, т.е. в соответствии с генетической программой клетки. Если бы сам механизм был «прост»

(не «упрятан»), а вытекающие из него следствия – абсолютно «прозрачны», то он, скорее всего, был бы уже показан. А многие проблемы, включая ВИЧ/СПИД, были бы ближе к их теоретическому осмыслению и практическому применению. Возможно, потребовалось бы пересмотреть некоторые положения в биологии/медицине. Это, однако, будет сознательно/подсознательно тормозиться успешными высокопоставленными специалистами из различных областей (несмотря на то, что они получат много рабочих мест и повод подтвердить свою значимость среди властных структур, граждан и обывателей). Современный Ч.Дарвину эволюционизм вызревал (развиваясь в работах эрудированных дилетантов от биологии; стуктурированность биологии была совершенно иной) на протяжении трех сотен лет [32,33]… Эта статья написана в относительно «свободном» стиле: должно быть место не только строгим фактам из различных областей биомедицинской науки [10-16], но и мотивациям, связанным с предысторией вопроса. Мотивации могут продвигать или тормозить движение в выбранном направлении. Уже сейчас необходимо изложить сложившееся состояние вещей и возможные новые методологические подходы (буква закона формулируется в процессе формирования/усвоения его духа). Важно, чтобы это было услышано/применено – или хотя бы сохранено для развития проблемы в будущем; размышлять можно совместно.

Кратко перечислю те области и работы (включая научнопопулярные; тезисы), которые в свободном доступе имеются на сайте (http://amdeich-var-reverse-translation.ru/).

Предлагаемый гипотетический вПОТ-механизм, и во множестве связанных/не-связанных с ВИЧ/СПИД проблемой аспектах, обсуждается в большинстве работ, имеющихся на сайте (http://amdeich-var-...).

Для понимания молекулярного действия гипотетического вПОТмеханизма необходимо ознакомиться с работами [12,15]. В связи с ВИЧ/СПИД проблемой желательно прочитать работы [10,12,15]. В идеале, не плохо ознакомиться с работами, которые в разделе «Список литературы» сайта указаны, как «выполненные по теме» и которые, как правило, можно открыть (скачать). В книге «Редактирование РНК.

Гипотетические механизмы», 2005 – желательно посмотреть, по крайней мере, вторую ее часть («Гипотетические механизмы…» [12]); имеется на сайте в разделе «Книга».

Предлагаемый вПОТ-механизм (его предшественник) может не только связывать современные синтезы белка и нуклеиновых кислот, но и эволюционно предшествовать им. Заметим, что этот механизм (или подобный; впрочем, как и другие известные механизмы), вероятно, эволюционировал («сквозной эволюционизм» принципиален для статьи). Отражением этого являются предложенные различные способы реализации вПОТ-механизма у эукариот (в связи с внутренней мембраной митохондрии; у в.растений – и в связи с хлоропластами/тилакоидами) и у прокариот (в связи с цитоплазматической мембраной). Нельзя исключить, что аналоги этого механизма существовали и в «допрокариотический» период, т.к. в соответствии с «принципом непрерывности» Оргелла [67], в клетке явно или скрыто коэволюционируют взаимодействующие молекулы, их части и функции [78].

По другому, это механизм поддержания РНК/Белковой симметрии – что было обозначено в работе М.Нашимото [89]. Желательно, чтобы читатель ознакомился с ответной работой «Возвращаясь к вопросу о РНК/Белковой симметрии» [15] и сделал свои выводы. М.Нашимото пишет, что предлагаемый им вариант обратной трансляции, rTmechanism (от “reverse translation”), подкрепленный экспериментом (где показана возможность отдельных стадий этого процесса), существовал только в далеком прошлом – в эпоху т.н. РНК-Мира, RNA-World, ~ 3,8 млрд. лет назад; а затем, с формированием современных репликационного, транскрипционного и трансляционного аппаратов – исчез, т.к. стал представлять угрозу генетической перегрузки клетки. Почему он так написал – вопрос.



Ссылка на потенциальную генетическую перегрузку убедительно не выглядит, т.к. клетка умеет сохранять и поддерживать много разных типов перегрузок (генетических, иммунологических, биохимических).

И от использования уникальных, тонких, не всегда точных, не очевидно полезных и «высоко-затратных» механизмов клетка почему-то «не отказывается» (см. целую статью).

Возможно редакции журналов готовы публиковать только подход “step-by-step”, – и не готовы всесторонне обсуждать устоявшиеся догмы (например, ЦМБД – центральную догму молекулярной биологии, [10,12,13,15]). В журналах часто работают редакторы/ /рецензенты, которые ревностно «защищают» читателя от авторов, квалифицируемых как «возмутителей спокойствия» (спрашивается – чьего спокойствия?). В случае обсуждения ЦМБД опасаются реанимации в научном обиходе взглядов Т.Лысенко (это справедливо; но необходимо учесть, что ярые лысенковцы, сегодня, тон не задают, но при «борьбе» с ними удобно оттолкнуть любого другого), а также ламаркистов (которые, в изучаемых им объектах, часто обнаруживают далеко не только ламаркианские тенденции [68,71]). Последние, тем не менее, уже достаточно уверенно отстаивают свои позиции, например, в области молекулярной генетики прокариот; причем некоторые выходцы «из наших», зная историю вопроса изнутри, делают это даже активнее ученых Запада [71].

Это касается, например, защитных функций прокариот в отношении чужеродной ДНК (фагов, плазмид) при участии т.н. CRISPR-(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-локусов. Длинные транскрипты-предшественники локуса образуют короткие прокариотические РНК (CRISPR-RNAs, crRNAs), включающие почти идентичные регулярно расположенные повторы (21–47 п.н.) и уникальные (20–72 п.н.) спейсеры [43,46,79] (природа встраивания их в геном прокариот остается загадкой), которые узнают/нейтрализуют комплементарную им чужеродную ДНК.

Короткие РНК эукариот (microRNAs, siRNAs, piRNAs, др.; около десяти видов [16]) и прокариот (crRNAs) воспроизводятся разными белковыми системами. Но в обоих случаях соответствующие мишени деградируют за счет комплементарного взаимодействия: РНК/РНКвзаимодействия (интерференции РНК) в случае эукариот (деградируют мРНК); и РНК/ДНК-взаимодействия – в случае прокариот (деградирует «чужая» ДНК). Одна цель достигается разными средствами: это характерный признак науки диатропики, развиваемой, в частности, историком-эволюционистом Ю.В.Чайковским [32,33], учеником известного палеоботаника С.В. Мейена.

Возможно, М.Нашимото не увидел какой из вариантов “reverse translation” может работать сегодня. Но он допускал, что его rTmechanism может отличаться от реально работавшего в прошлом; а сегодня он просто иллюстрирует потенциальные возможности клетки [89]. Переписку М.Нашимото не поддержал, возможно, из-за различий в принципиальных моментах, «языковых» ограничений, или в силу ментальных причин («восток – дело тонкое»).

Но в отношении проблемы “reverse translation” можно придерживаться и другой точки зрения. Вероятнее, что, как минимум, один из вариантов этого механизма был взят клеткой (пре-клеточными структурами) под контроль, т.е. был встроен в общий контекст внутриклеточных генетических, биохимических и метаболических процессов эукариот (прокариот) и продолжает функционировать, обеспечивая поддержание РНК/Белковой симметрии, и в настоящее время. Перефразируя известный тезис Лавуазье-Ломоносова, можно еще раз повторить, что не только химическое вещество «не появляется из ниоткуда и не исчезает в никуда», но и управляющие его превращениями в организме биохимические процессы, молекулярные механизмы (согласно «принципу непрерывности» Оргелла [67]) – также не исчезают, а лишь изменяются (коэволюционируют) вместе с преобразуемым ими веществом [78]. Более того, в соответствии с принципом диатропики [32,33], в природе (экосистемах, сообществе, организме, клетке, геноме) обычно сохраняются несколько путей, ведущих к достижению одной цели.

Именно поэтому, реализуясь в разных генетических системах, предлагаемый вПОТ-механизм, как и синтезы белка (в цитоплазме/митохондриях/хлоропластах) и нуклеиновых кислот (в ядре/ /органеллах), представлен несколькими вариантами [12,15].

В моем понимании «РНК/Белковая симметрия» также означает возможность поиска потенциального взаимосоответствия между белковыми и нуклеиновокислотными структурами, т.е., не исключено, соответствия между аминокислотами и их кодонами, – в продолжающемся процессе формирования современного универсального генетического кода (УГК) в абсорбирующих фотоны хлоропластах/тилакоидах фотосинтезирующих организмов [15]. Биохимия этого процесса, предполагается, опосредуется вПОТ-механизмом (мембранозависимо), а физика (биофизика) – энерголучевым потоком, ЭЛП (см. ниже). Для подобного поиска, в гипотезе М.Нашимото [89] много чего недостает, – хотя сам факт публикации его статьи (с экспериментальной и некоторой теоретической разработками) выглядит весьма обнадеживающе (публикации дали состояться).

Мы живем в мире, в котором любая долговременная стабильность (генетическая, биохимическая, метаболическая) может поддерживаться только с одновременным синхронным изменением уровня/состава всех взаимодействующих компонент метаболических кибернетических машин [29,30], – каковыми являются клетки и внутриклеточные органеллы, частицы, структуры, биомолекулы. Существует вероятность, что даже простое поддержание и сохранение того, что уже есть – также происходит в процессе динамической проверки элементов в.н. объектов на соответствие их целостным структурам (различными способами, и на различных их уровнях). Изменения отражают самоорганизующие свойства при сборке компонент в единую в.н «машину».



Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |   ...   | 12 |
 



Похожие работы:

«СОВРЕМЕННЫЕ ПРОБЛЕМЫ ПРОИЗВОДСТВА И РЕМОНТА В ПРОМЫШЛЕННОСТИ И НА ТРАНСПОРТЕ Материалы 10-го Юбилейного Международного научно-технического семинара (22-26 февраля 2010 г., г. Свалява, Карпаты) Киев – 2010 1 Современные проблемы производства и ремонта в промышленности и на транспорте : Материалы 10-го Юбилейного Международного научно-технического семинара, 22–26 февраля 2010 г., г. Свалява. – Киев : АТМ Украины, 2010. – 322 с. Тематика семинара: Современные тенденции развития технологии...»

«ГАЗОРАЗРЯДНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ПРОЛИФЕРАТИВНОЙ АКТИВНОСТИ МОНОНУКЛЕАРОВ О. В. Сорокин1, В. В. Абрамов2, В. Ю. Куликов1, К. Г. Коротков3 1 ГУ ВПО Новосибирский государственный медицинский университет Росздрава (г. Новосибирск) 2 Институт клинической иммунологии СО РАМН (г. Новосибирск) 3 НИИ физической культуры и спорта (г. Санкт-Петербург) В статье описывается проверка гипотезы о связи метаболической активности клеток с параметрами оптико-электронной эмиссии в условиях пролиферативного ответа на...»

«Старинные традиции народного врачевания в значительной мере обогащают и дополняют современную медицину, становятся неотъемлемой частью нашей жизни. К числу наиболее древних методов профилактики и лечения заболеваний относится массаж. У разных народов существуют свои оригинальные методики нелекарственного поддержания хорошего самочувствия. В книге собраны наиболее популярные техники лечебного массажа, причем не только древние, пользующиеся заслуженной славой на протяжении веков, но и появившиеся...»

«Административное право Российской Федерации Учебник Рекомендовано Советом по правоведению Учебно-методического объединения университетов Российской Федерации Авторы Алехин Алексей Петрович, Заслуженный юрист РФ, доктор юридических наук, профессор — главы: 5—10, 13—15, 17, 20—23, 31, 32; Кармолицкий Анатолий Александрович, кандидат юридических наук, доцент — главы: 18, 19, 34—40; Козлов Юрий Маркович, Заслуженный деятель науки Российской Федерации, доктор юридических наук, профессор — главы:...»

«Выполнение научно–исследовательской работы кафедры нормальной физиологии им. И.А. Чуевского в рамках научного направления кафедры за 2006–2011 гг. РУКОВОДИТЕЛЬ Киричук Вячеслав Федорович, доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой нормальной физиологии им. И.А. Чуевского, Заслуженный деятель науки РФ, Академик МАНВШ и РАМТН. ВЕДУЩИЕ СПЕЦИАЛИСТЫ • Понукалина Елена Вячеславовна, доктор медицинских наук, профессор, профессор кафедры нормальной физиологии им. И.А. Чуевского, • Андронов...»

«8-9 апреля 2013 года ЭЛЕКТРОТЕХНИЧЕСКИЕ КОМПЛЕКСЫ И СИСТЕМЫ УДК 621.879 ОПИСАНИЕ УСТРОЙСТВА УПРАВЛЕНИЯ АВТОМАТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ РЕГУЛИРОВАНИЯ ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТИ ДРОБИЛКИ Дубинин А. В., Карякин А. Л. ФГБОУ ВПО Уральский горный государственный университет Автоматизация и механизация производственных процессов это основное направление развития российской экономики на ближайшие годы. Важнейшим средством электрификации, механизации и автоматизации, основой увеличения производительности машинного...»

«Moscow •2002 B.K. ЛОМАКИН МИРОВАЯ ЭКОНОМИКА Второе издание, переработанное и дополненное Рекомендовано Министерством образования Российской Федерации в качестве учебника для студентов высших учебных заведений, обучающихся по экономическим специальностям и направлениям Москва • 2002 2 УДК 339.9(075.8) ББК 65.5я73 Л74 Рецензенты: кафедра экономики зарубежных стран и внешнеэкономических связей Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова; д-р экон. наук, проф. А.В. Ветров; д-р...»

«3 70 лет кафедре электротехники ЧЕЛЯБИНСК 2014 В юбилейные даты мы оглядываемся на свое прошлое, чтобы объективно оценить свое настоящее. В.Шекспир 4 ОГЛАВЛЕНИЕ 1. История развития..4 2. Методическая работа..21 3. Научная работа..23 4. Сотрудничество с предприятиями..27 5. Международная деятельность..28 6. Наши заведующие кафедрой..31 7. Преподаватели кафедры..40 8. Сотрудники кафедры..62 9. Спортивная жизнь кафедры..67 10. Наши выпускники..68 5 Кирпичникова Ирина Михайловна Коголь Ида...»

«Политическое измерение мировых финансовых кризисов Феноменология, теория, устранение Москва Научный эксперт 2012 УДК 336.02(063) ББК 65.261-18 Я 49 Якунин В.И., Сулакшин С.С., Аверкова Н.А., Багдасарян В.Э., Богдан И.В., Вершинин А.А., Генюш С.В., Деева М.В., Коробкова А.Ю., Куропаткина О.В., Орлов И.Б., Сафонова Ю.А., Сулакшина А.С., Шестопалова А.В. Я 49 Политическое измерение мировых финансовых кризисов. Феноменология, теория, устранение. М.: Научный эксперт, 2012. — 632 с. Под общ. ред....»

«Логиновских Т.А. Социальный эксперимент как форма инновационной практики Монография Екатеринбург РГППУ 2011 2 Логиновских Т. А. Социальный эксперимент как форма инновационной практики: моногафия Логиновских Т. А. Екатеринбург: Изд-во Рос. гос. проф.-пед. ун-та. 2011. 119 с. В монографии рассматривается понятие социальный эксперимент, структура, типы социальных экспериментов. Подчеркиваются утопические и реалистические аспекты в социальных экспериментах, идеалообразование как механизм...»






 
© 2013 www.knigi.konflib.ru - «Бесплатная электронная библиотека»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.